Саша! Мильчин в своём справочнике не указывает, какой именно пробел использовать, но пишет:

«При упрощённом электронном наборе… пробелы между группами цифр равны апрошам предложения, из-за чего числа из четырёх и более знаков… разваливаются и могут восприниматься как ряд чисел, а не как единое число».

Так что размер пробела лучше всего подобрать на глаз исходя из этих соображений (которые и вы привели). Дело в том, что выбор этот зависит и от шрифта, и от типа носителя, и даже от контекста, поэтому было бы неправильно постановить, что это всегда ровно половина пробела. В некоторых случаях даже полный пробел будет хорошо смотреться, а в некоторых достаточно и трети.