Георгий!

Убрав из договора пункт об упрощёнке, вы не превратитесь в плательщика налога на добавленную стоимость, зато увеличите неопределённость в отношениях.

Вдруг бухгалтер клиента забудет о том, что вы работаете на упрощёнке и перечислит платёж вместе с НДС, а потом потребует счёт-фактуру? Вдруг аудиторы потребуют расторгнуть договор, потому что с их точки зрения договор без пункта об упрощёнке ухудшает шансы компании пройти налоговую проверку?

Мне странно, что клиент хочет исключить из договора пункт об упрощёнке, ведь он — в мире клиента. Поэтому поговорите с клиентом и выясните, почему он хочет избавиться от пункта. Результат встречи поможет найти решение, которое не будет компромиссом и устроит обе стороны.